Новини - Потенциални методи за разграждане на пептиди

Потенциални методи за разграждане на пептиди

Химическата резистентност на пептидите зависи от състава и последователността на аминокиселините. Лиофилизираните пептиди обикновено са по -издръжливи от техните колеги в разтвор. Потенциалните методи за разграждане на пептидите са както следва:

1, Хидролиза: Това обикновено е включено в ASP в последователността (D) За проблема в пептида, той е много лесно дехидратиран да образува междинно съединение на пръстен. Например, има ASP в последователността. -Pro (DP) В този случай имидът с форма на пръстен имид, произведен чрез киселинна катализа, би довел до разцепване на пептидната верига. По същия начин, ASP-Gly (DG) присъства в последователността и в този случай кръгъл междинно устройство може да бъде хидролизиран в оригиналния ASP режим на изоспартна киселина (безобидна) или потенциално неактивен аналог. И накрая, всички модели на аспарагинова киселина могат да бъдат напълно превърнати в аналози на изоспартна киселина. „На по -малко ниво тя съдържа Ser (S), последователност, която също образува кръгов имид междинно съединение, което в крайна сметка почиства пептидната верига.“

2, дезамидация: Тази основна катализирана реакция често се проявява в присъствието на ASN-Gly (NG) или Gln-Gly (QG) в последователността и следва подобен механизъм на последователност на ASP-Gly (DG). Деаминирането (загуба на амин) в последователността на ASN-Gly се получава цикличен имиден междинен продукт, който след това се хидролизира, за да се получи аналози на ASN Aspartic Acid или изоспартна киселина. В допълнение, междинният продукт на пръстена може да причини D-ASP или външна деротация на Asnd-ISO-нещо подобно на ASP, всички от които могат да бъдат неактивни.

3, Окисляване: Cys и MET остатъци са основните остатъци, които претърпяват обратимо окисляване. Окисляването на цистеина се ускорява при по -високи стойности на рН, където тиолът по -лесно премахва протонирането и е предразположен към генериране на дисулфидни връзки във или между вериги. Дисулфидната връзка може лесно да се обърне чрез лечение с дитиотреитол (DTT) или Tris (2-карбоксилетилфосфин) хидрохлорид (TCEP). Метионинът се окислява чрез химическа и фотохимия за получаване на метионинов диоксид, който допълнително навлиза в метионинов диоксид, като и двете са трудни за обръщане.

1

4, Diketopiperazine and pyroglutamic acid production: formation of dimethylpiperazine usually occurs when Gly is in the third position of the N terminus, especially if Pro or Gly is in position 1 or 2. This reaction involves nucleophilic attack of the N-terminal nitrogen on the amide benzyl group between the second and third amino acids, resulting in cleavage of the first two amino acids of the Метод на дикетопиперазазин. От друга страна, ако GLN е разположен в N-края, образуването на пироглутаминова киселина е почти неизбежно. Това е подобна реакция, при която N-терминалният азот атакува основния въглерод на страничната верига на GLN, за да образува дезаминиране на аналог на пироглутамил пептид. Тази конверсия се осъществява и с N-края, съдържащ пироглутаматни пептидни аналози.

5. Рацемизация: Този термин се използва широко за обозначаване на общата загуба на хирална цялост на аминокиселина или пептид. Рацемизацията включва превръщането на аминокиселина от базово-катализиран енантиомер, обикновено L-форма, до тип 1 на енантиомерите L-и D-форма. : 1. Смес. Това е по -важно по време на генерирането на пептиди, но по -малко проблематично в готовия пептид. В допълнение, превключвателят е труден за откриване и не може да бъде контролиран.

Общ подход за избягване или минимизиране на разграждането на пептида е разграждането на пептида до-20 ° С или по-добре-80 ° С за сушене на замразяване, ако е налично. Ако пептидът е във воден разтвор, всяка проба от аликвота трябва да бъде замразена, за да се избегне замразяване и размразяване. Излагането на pH & GT трябва да се избягва; Среда 8. Въпреки това, ако се изисква pH & gt; Ако пептидът се стопи при 8, експозицията му трябва да бъде минимална.


Време за публикация: 2025-07-01