Клетъчно проникващите пептиди са малки пептиди, които лесно могат да проникнат в клетъчната мембрана. Този клас молекули, особено CPP с насочени функции, обещава за ефективно доставяне на лекарства до целевите клетки.
Следователно изследването върху ИТ има определено биомедицинско значение. В това проучване CPP с различни трансмембранни дейности са проучени на ниво на последователност, опитвайки се да установят факторите, влияещи върху трансмембранната активност на CPP, разликите в последователността между CPP с различни дейности и неКПП и въвеждане на метод за анализ на биологични последователности.
CPPS и NonCPPS последователности са получени от базата данни на CPPSITE и различни литератури и трансмембранни пептиди (HCPP, MCPP, LCPP) с висока, средна и ниска трансмембранна активност се извличат от последователностите на CPPS за конструиране на набори от данни. Въз основа на тези набори от данни бяха проведени следните проучвания:
1, аминокиселината и вторичната структура на състава на различни активни CPP и неКПП са анализирани чрез ANOVA. Установено е, че електростатичните и хидрофобните взаимодействия на аминокиселините играят важна роля за трансмембранната активност на CPP, а спиралната структура и случайното намотка също повлияват на трансмембранната активност на CPP.
2. Физическите и химичните свойства и дължините на CPP с различни дейности бяха показани на двуизмерната равнина. Установено е, че CPP и неКПП с различни дейности могат да бъдат групирани под някои специални свойства, а HCPP, MCPP, LCPP и неКПП са разделени на три клъстера, показващи различията им;
3. В този документ се въвежда концепцията за физически и химичен центроид на биологична последователност и остатъците, съставящи последователността, се считат за точки на частици и последователността се абстрахира като система от частици за изследване. Този метод се прилага при анализа на CPP чрез проектиране на CPP с различни дейности върху 3D равнината по метода на PCA и беше установено, че повечето CPP се групират заедно и някои LCPPS, струпнали заедно с неКПП.
Това проучване има последици за проектирането на CPP и разбирането на разликите в последователностите на CPP с различни дейности. В допълнение, методът на анализ на физически и химически центроид на биологични последователности, въведен в този документ, може да се използва и за анализ на други биологични проблеми. В същото време те могат да бъдат използвани като входни параметри за някои проблеми с биологичната класификация и да играят роля в разпознаването на образи.
Време за публикация: 2025-07-02