Схема за проектиране и разтвор на полипептидна пептидна верига

I. Обобщение
Пептидите са специални макромолекули, така че техните последователности са необичайни в техните химически и физически характеристики. Някои пептиди са трудни за синтез, докато други са сравнително лесни за синтез, но трудни за пречистване. The practical problem is that most peptides are slightly soluble in aqueous solutions, so in our purification, the corresponding part of the hydrophobic peptide must be dissolved in non-aqueous solvents, Therefore, these solvents or buffers are likely to be severely inconsistent with the use of biological experimental procedures, so that technicians are strictly prohibited from using the peptide for their own purposes, so that the following are several Аспекти на проектирането на пептиди за изследователи.

Схема за проектиране и разтвор на полипептидна пептидна верига
Второ, правилния избор на синтетични трудни пептиди
1. Обща дължина на регулирани последователности надолу
Пептидите с по -малко от 15 остатъка са по -лесни за получаване, тъй като размерът на пептида се увеличава и чистотата на суровия продукт намалява. Тъй като общата дължина на пептидната верига се увеличава над 20 остатъка, точното количество на продукта е ключов проблем. В много експерименти е лесно да се получат неочаквани ефекти чрез понижаване на номера на остатъците под 20.
2. Намалете броя на хидрофобните остатъци
Пептидите с голямо преобладаване на хидрофобни остатъци, особено в остатъците от региона 7-12 от С-края, обикновено причиняват синтетични затруднения. Това се разглежда като неадекватна комбинация именно защото в синтеза се получава лист с B-сгъстяване. „В такива случаи може да е полезно да преобразувате повече от два положителни и отрицателни остатъка или да се поставят GLY или PRO в пептида, за да отключите пептидния състав.“
3. Понижаване на „трудни“ остатъци
„Има редица CYS, MET, ARG и опитайте остатъци, които по принцип не са лесно синтезирани.“ SER обикновено ще се използва като неокислителна алтернатива на CYS.
Схема за проектиране и разтвор на полипептидна пептидна верига

Трето, подобрете правилния избор на разтворими във вода
1. Регулирайте N или C терминала
В сравнение с киселите пептиди (тоест отрицателно заредени при рН 7), ацетилиране (ацетилиране на N-край, С терминусът, който винаги поддържа свободна карбоксилна група), е особено препоръчително за увеличаване на отрицателния заряд. Въпреки това, за основните пептиди (тоест положително заредени при рН 7), аминацията (свободна амино група при N-края и аминацията при С-края) се препоръчва особено да се увеличи положителният заряд.

2. Значително съкратете или удължете последователността

Някои от последователностите съдържат голям брой хидрофобни аминокиселини, като Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr и ALA и др. Когато тези хидрофобни остатъци надвишават 50%, те обикновено не са лесни за разтваряне. Може да е полезно да удължите последователността, за да се увеличи допълнително положителните и отрицателните полюси на пептида. Вторият вариант е да се понижи размера на пептидната верига, за да се увеличат положителните и отрицателните полюси чрез понижаване на хидрофобните остатъци. Колкото по -силна е положителната и отрицателната страна на пептидната верига, толкова по -голяма е вероятността да се реагира с вода.
3. Поставете във водоразтворим остатък
За някои пептидни вериги комбинацията от някои положителни и отрицателни аминокиселини може да подобри разтворимостта на водата. Нашата компания препоръчва N-края или С-края на киселите пептиди да се комбинират с Glu-Glu. Даден е N или C терминът на основния пептид и след това Lys-Lys. Ако заредената група не може да бъде поставена, Ser-Gly-SER може да бъде поставен и в N или C терминала. Този подход обаче не работи, когато страните на пептидната верига не могат да бъдат променени.